违法由哪个部门确定

违法案件的确定部门主要根据违法类型和具体情况而定：

土地、矿产、城乡规划违法案件 ：这类案件由不动产所在地的县级自然资源主管部门管辖。

测绘地理信息违法案件：

这类案件由违法行为发生地的县级自然资源主管部门管辖，若难以确定违法行为发生地，则可以由涉嫌违法的公民、法人或其他组织的单位注册地、办公场所所在地、个人户籍所在地的县级自然资源主管部门管辖。

违法建筑（违章建筑）的认定

违章建筑的认定通常由县级以上人民政府土地行政主管部门负责，现实中一般由住建部门和市政管理部门负责。

认定违章建筑时，需考虑是否依法申办了建筑用地规划许可、建设工程许可手续，以及是否违反城乡整体规划。

其他违法建设

其他违法建设案件，如占用耕地建窑、建坟或擅自在耕地上建房等，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令限期改正或治理，可以并处罚款。

综上所述，违法案件的确定部门主要依据违法类型和具体情况而定，涉及土地、矿产、城乡规划、测绘地理信息、违法建筑等多个方面。具体负责部门包括自然资源主管部门、住建部门、市政管理部门和土地行政主管部门等。

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